Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms