Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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