Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms