Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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