Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms