Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX20Q7Z614 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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