Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms