Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms