Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP4R4Q6NUP7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms