Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP9Q5VTM2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms