Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms