Protein–RNA interactions for Protein: Q49AJ0

FAM135B, Protein FAM135B, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM135BQ49AJ0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM135BQ49AJ0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM135BQ49AJ0 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms