Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms