Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms