Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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