Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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