Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CARTPTQ16568 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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