Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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