Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms