Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CCDC85BQ15834 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CCDC85BQ15834 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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