Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA2Q15822 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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