Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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