Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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UBE3CQ15386 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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UBE3CQ15386 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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UBE3CQ15386 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3CQ15386 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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