Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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