Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD3Q15054 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms