Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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