Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms