Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms