Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SPIDRQ14159 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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