Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL9A3Q14050 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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