Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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