Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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