Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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