Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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