Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NAE1Q13564 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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