Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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