Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms