Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SCGB2A2Q13296 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SCGB2A2Q13296 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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