Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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