Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms