Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TRIM32Q13049 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TRIM32Q13049 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TRIM32Q13049 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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TRIM32Q13049 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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TRIM32Q13049 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM32Q13049 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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