Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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