Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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