Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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