Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms