Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms