Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms