Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PAX8Q06710 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms