Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms