Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms